Effiziente Isolierung qualitativ hochwertiger cfDNA

In der biomedizinischen Forschung hat cell free DNA (cfDNA) in den letzten Jahren stark an Bedeutung gewonnen, da sie einen minimal invasiven Zugang zu genetischen Informationen ermöglicht.

cfDNA bezeichnet kurze, extrazelluläre DNA Fragmente, die unter anderem von apoptotischen und nekrotischen Zellen freigesetzt werden und in Körperflüssigkeiten wie Blutplasma, Serum, Urin oder Liquor zu finden sind.

Die Analyse von cfDNA liefert wertvolle Einblicke beispielsweise in der Krebs‑ und Transplantationsforschung oder der pränatalen Diagnostik. Fortschritte in der Isolierung, Quantifizierung und Sequenzierung von cfDNA tragen entscheidend dazu bei, Sensitivität, Reproduzierbarkeit und Aussagekraft entsprechender Forschungsansätze weiter zu verbessern.

Das neue Monarch Mag Cell-free DNA Extraction Kit von New England Biolabs ermöglicht eine zuverlässige Aufreinigung zirkulierender cfDNA aus Bioflüssigkeiten. Die Silica beschichteten Magnetic-Beads und optimierte Puffer sorgen für eine effiziente Bindung und Aufreinigung Ihrer cfDNA und ermöglichen eine einfache Skalierung und Automatisierung.

Ihre Vorteile im Überblick:

  • Einfache Isolierung von cfDNA aus Plasma, Urin oder Cerebrospinalflüssigkeit
  • Geringes Elutionsvolumen (≥15 µl) für eine hohe DNA Konzentration
  • Für typische cfDNA Fragmentgrößen von 50–300 bp
  • Flexibles Inputvolumen von 1–4 ml
  • Magnetic-Bead basiertes Kit für eine einfache Skalierung (mit KingFisher® Flex oder anderen Plattformen)

Das Monarch Mag Cell-free DNA Extraction Kit erzielt im Vergleich zu anderen Anbietern eine höhere Ausbeute.

Plasma wurde mit der Low Molecular Weight Ladder (NEB #N3233S) versetzt, um fragmentierte cfDNA zu simulieren, und anschließend mit dem Monarch Mag Cell-free DNA Extraction Kit sowie zwei weiteren kommerziellen cfDNA Kits aufgereinigt. Das Monarch Kit erzielt sowohl im typischen cfDNA Fragmentbereich von 150 bis 300 bp als auch bei anderen Fragmentgrößen eine höhere Ausbeute.

Die aufgereinigte cfDNA erfüllt höchste Qualitätsanforderungen für sensible Anwendungen wie die Sequenzierung zur Mutationsanalyse, den Nachweis von Methylierungsmustern oder Amplifikationsmethoden wie die digitale PCR. In Kombination mit Sequenzier- und Amplifikationslösungen von NEB entsteht ein durchgängiger Workflow, der hochwertige Daten auch aus anspruchsvollen Proben liefert.

Weitere Informationen sowie kostenfreie Testmuster finden Sie hier!

Kontakt:

New England Biolabs GmbH
Brüningstraße 50, Geb. B852
65926 Frankfurt / Main
www.neb-online.de
info.de@neb.com

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